2010年9月13日月曜日

平衡状態を高速に求めるためのsampling手法

multiple time step, REPSA
mass scaling method, Feenstra, K. A.; Hess, B.; Berendsen, H. J. C. J Comput Chem 1999, 20, 786. 
Mass tensor molecular dynamics, Charles H. Bennett

multicanonical
metadynamics
umbrella sampling
steered MD
lambda-dynamics
Adiabatic free energy dynamics (AFED)
reference potential spatial warping algorithm (REPSWA)